En avril 2009, le Grand Conseil du canton de Neuchâtel, sous l'impulsion du Conseil d'Etat, donnait le feu vert à la création d'un pôle de la microtechnique dans le chef-lieu.
En septembre 2013, soit moins de 2 ans après la pose de la première pierre, Microcity a été remis à son nouvel exploitant, l'Ecole polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL). Ce nouveau bâtiment permettra à l’Institut de microtechnique (IMT), rattaché à l'EPFL, de se regrouper et de se développer à Neuchâtel.
L'objectif est d'y implanter 12 chaires et de développer l’antenne neuchâteloise de l’EPFL dans le "green manufacturing". Microcity aura aussi pour mission de conserver sa vocation de valorisation et de relation avec l’industrie. A terme, 600 personnes travailleront sur le site, contribuant ainsi au rayonnement du canton de Neuchâtel dans le domaine des technologies de pointe.
La BCN, séduite d'emblée par le projet, a fortement contribué à la concrétisation du projet. Elle a versé CHF 50 millions à l’Etat pour le financement de la construction du bâtiment. Ce montant se répartit sous la forme d’un remboursement de 25 millions du capital de dotation de la BCN et du paiement d’un agio du même montant.
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